Un ninja doit maitrisés le ninjutsu. Mais chaque ninjas à des affinités spécifique à leur propre personne et qui modifie son arsenal de technique.
Suivant le rang, voici les règles des affinités:
Liste des affinités
Infériorité et Supériorité des affinités:-Doton: Element terre, avantage sur le Suiton, désavantage sur le Raiton
-Suiton: Element eau, avantage sur le Katon, désavantage sur le Doton
-Katon: Element feu, avantage sur le Fuuton, désavantage sur le Suiton
-Fuuton: Element vent, avantage sur le Raiton, désavantage sur le Katon
-Raiton: Element foudre, avantage sur le Doton, désavantage sur le Fuuton
Affinités Doubles:-Hyoton: L'art de manipuler la glace (Fuuton + Suiton), clan Hyori uniquement.
-Mokuton: L'art de manipuler le bois (Suiton + Doton), clan Senju uniquement.
-Kinton:L'art de manipuler le métal (Doton + Raiton), Sasori uniquement.
-Yoton: L'art de manipuler la lave (Doton + Katon), jinchuriki du Yonbi, capacités du Bijuu.
-Sabaku: L'art de manipuler le sable (Doton + Fuuton), Jinchuriki du Ichibi, capacités du Bijuu
Nombre d'affinités par personne
-Genin: Pas d'affinités, sauf si fait partie d'un clan ou une affinité est de famille.
-Chuunin: 1 affinité
-Juunin et autres: 2 affinités
-Kage/ Chef d'organisation: 3 affinités